痔疮手术后第五六天最疼可能是因为长效麻醉药药效已过、排便不当、疾病本身引起、解剖结构引起、治疗引起、各科并发症引起，具体分为以下几点：
1、长效麻醉药药效已过：患者患处的知觉恢复了，渐渐可以感受到被麻醉药、止痛药掩盖住的术后疼痛，就会觉得特别痛。
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2、排便不当：患者术后常因粪便排出时用力，粪便机械性摩擦创面引起疼痛；或术后切口愈合形成瘢痕，排便时瘢痕受到一定程度的牵拉，或痉挛压迫末梢神经而引起疼痛。
3、疾病本身引起：疾病本身也会使疼痛发生并加剧，如炎性外痔、血栓外痔、肛裂等。
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4、解剖结构引起：痔疮所在部位比较特殊，肛缘皮肤薄，肛门神经也比较丰富敏感，肛管括约肌舒缩敏锐，所以术后容易引起疼痛或感觉到疼痛。
5、治疗引起的疼痛：如换药对手术创面的刺激。
6、各科并发症引起的疼痛：如局部感染、便秘、水肿、血栓、化脓而引起的疼痛。
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